Isi buku ini mencakup pembahasan tentang Fitomikrobiologi, konsep dasar fitomikrobiologi, mikroorganisme indigenus (fungi, bakteri, actinomycetes) yang menguntungkan bagi tanaman, mikroorganisme yang berpotensi menghasilkan metabolit primer dan metabolit sekunder yang bermanfaat bagi tanaman, mikroorganisme yang berperan sebagai agen hayati, mikroorganisme yang berperan sebagai agen biokontrol, mikroorganisme endofitik dan filosfer, mikroorganisme pelarut fosfat dan penambat nitrogen, teknik inokulasi mikroorganisme yang berpotensi sesuai pemanfaatan untuk aplikasinya, dan mikroorganisme: fungi, bakteri, dan virus yang berperan sebagai patogen tanaman.