Fermentasi adalah salah satu bioteknologi tertua untuk produksi produk makanan dengan sifat-sifat yang diinginkan, seperti umur simpan yang lebih lama dan sifat organoleptik yang baik (Smid dan Hugenholtz, 2010). Makanan yang telah difermentasi biasanya meningkatkan stabilitas mikroba dan keamanannya serta beberapa dapat disimpan bahkan pada suhu ruangan. Selain itu, ada beberapa contoh proses fermentasi yang menghasilkan peningkatan nilai gizi atau daya cerna (Jägerstad et al., 2005) dari bahan baku makanan. Proses fermentasi makanan juga menghasilkan produk dengan daya tarik rasa yang lebih tinggi bagi konsumen. Semua argumen ini telah meningkatkan minat untuk mengeksplorasi proses fermentasi makanan alami, dan lebih tepatnya untuk mengaitkan keragaman komunitas mikroba yang melakukan fermentasi dengan sifat-sifat proses dan kualitas produk.